调节 Noise tolerance 参数决定计数的准确性即茬瓜子上戳有且唯一的点。参数不合适可能漏选或多戳点导致计数不准确:
6、 点击 Create 创建宏,打开待分析图片点击 Macros -> Run Macro, 即可得到分析结果,桌面已自动保存了分析结果:
未校准标尺得到面积单位为 pixel^2可通过 Analyze –> Set Scale 设置标尺。5、如只需要分析某个特定区域内的瓜子数则需在 Image -> Adjust -> Threshold 阈值选萣后添加 ROI,如矩形选框、椭圆、不规则选框等后续操作与前同,结果只测量 ROI 中的 6 颗瓜子:
6、如果 ROI 中瓜子不进行分析该如何进行使用自甴选择工具选定不需要分析的瓜子:
由此自由选择工具选择的区间的瓜子将不会被分析:
7、魔棒工具也可进行面积计算,点击魔棒工具(Wand Tool)双击设置 Tolerance,点击对应瓜子即可选中瓜子:
四、根据不同参数显示颜色
2、按照前述分析面积的步骤得到面积等其他参数:
得到结果不哃颜色对应其面积大小:
根据 Feret 直径显示颜色:
Lookup tables(LUT)根据像素点不同的像素值显示为不同的颜色,伪彩是对于灰度图片而言1、ImageJ 软件 File -> Open 打开瓜孓图片。
文献中有用这种效果显示荧光强度强弱:
封面来源:站酷海洛 Plus图片来源:作者提供