请教Q柱revelutionn Buffer 如何配置

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这个帖子发布于8年零226天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我的蛋白是大肠杆菌重组表达的,80KD左右,在包涵体中,接有histag,用Ni柱纯化挂不上柱,后预测了一下等电点为5.4左右,故采用了阴离子交换柱纯化,柱子是GE的1ml的HiTrap Q FF,starting buffer为20nm的Tris,PH9.0,结果是蛋白挂不上柱,把样品中尿素透析后还是挂不上柱。不知道问题出哪了,请各位大虾指教,不胜感激!
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我觉得用ni柱是最方便,最容易的。一般都是阴离子挂不住了,然后就换到NI柱了。你的蛋白太大了80kD,虽然理论上小于500kd都可以用阴离子柱,但是我的经验的确超过50kd,挂阴离子的确不那么容易的。我建议你还是用Ni柱,要注意的一点是你的buffer中不要加入ARG之类的可以和NI相互作用的小分子,NI柱按照mannul,仔细处理应该问题不大的。
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谢谢yunerwenyu!我一开始就是用Ni柱纯化的,我们实验室也有完整的protocol,但试了几次都挂不上柱的,后来才考虑用离子交换的,问一下ARG是什么?
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你这个是包涵体的离子交换纯化,你的蛋白溶解在8M脲中,对吧? 如果是这样,Starting Buffer 和Elution Buffer里面都要含有8M脲的,这样才能在变性条件下上离子交换柱纯化蛋白,这些介质在8M尿素里应该没关系。你想,如果你的蛋白是变性的,而上样里面没有尿素,蛋白都沉淀了,怎么挂柱?如果Ni柱实在不行,包涵体洗涤后溶解在含8M脲的Starting Buffer内,离子交换纯化
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panrong 谢谢yunerwenyu!我一开始就是用Ni柱纯化的,我们实验室也有完整的protocol,但试了几次都挂不上柱的,后来才考虑用离子交换的,问一下ARG是什么?Arg:Arginine因为复性buffer里面通常含有Arg.本来想问一下您有没有带His-Tag的蛋白来验证Ni column没问题,不过您说实验室有完整的protocol应该是没问题了;20 nm Tris?是笔误吧?请问您在做阴离子交换之前conductivity是多少?希望不是很高。我有段时间做cation exchange也是发现蛋白没挂柱,后来降低了cond就好了。 PI 5点多,除了his外还有没有其它氨基酸?算上没有?供您参考~
amberly edited on
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conductivity,是盐浓度的意思吧?坦白的说,我纯化蛋白也有几百个了,(包括复性),我一直觉得蛋白很少有不挂ni柱的。考虑蛋白是包含体,histag被降解掉的可能性非常的小,还是怀疑你的ni柱有问题的。建议你象amberly兄所说的作个正对照。尤其是变形的条件下,应该更加容易挂柱才对。1、pH最好在8左右。2、上样的时候,一定要让填料和你的蛋白样品用磁子搅拌半个小时(我怀疑你是直接将蛋白流过了柱子,这样效果很差)。
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riboenzyme 你这个是包涵体的离子交换纯化,你的蛋白溶解在8M脲中,对吧? 如果是这样,Starting Buffer 和Elution Buffer里面都要含有8M脲的,这样才能在变性条件下上离子交换柱纯化蛋白,这些介质在8M尿素里应该没关系。你想,如果你的蛋白是变性的,而上样里面没有尿素,蛋白都沉淀了,怎么挂柱?如果Ni柱实在不行,包涵体洗涤后溶解在含8M脲的Starting Buffer内,离子交换纯化之前试过的,starting buffer 和elution buffer里都含有8M脲 ,发现蛋白挂不上柱,怀疑脲有影响,后来就用starting burrer 透析了样品,去除脲的影响,蛋白仍挂不上柱,透析时蛋白有沉淀,离心后上清还是有目的蛋白的,用上清上样。starting buffer 是20mM的tris,笔误了
关于丁香园Resource Q柱蛋白不挂柱,求助
14:43:13&&&来源:&&&评论:&&
Resource Q柱蛋白不挂柱,求助 敢问各位高手,我的蛋白等电点是5.14,用Resource Q柱纯化,蛋白不挂柱,缓冲液用过ph8.0,8.5,9.0的Tris,甘氨酸都不挂柱,敢问各位高手有何高见?急啊。…
敢问各位高手,我的蛋白等电点是5.14,用Resource Q柱纯化,蛋白不挂柱,缓冲液用过ph8.0,8.5,9.0的Tris,甘氨酸都不挂柱,敢问各位高手有何高见?急啊。回复:
8月21号的贴子,过了这么久了。。。估计问题也解决了吧。。。
Resource Q柱,强阴柱,如果全穿透了,我会首先考虑buffer 的pH值是否准确,样品本身电导是否过高(盐),另外最好把柱体积(CV),上样量和流速等等参数说一下,还有,你蛋白如果pI是5.14,酸性蛋白,可以用低一个pI的阳离子SP,CM柱(5.14真是低呢)或高一个pI的Q柱,DEAE柱,buffer的pH远高于pI了,不会对蛋白活性有影响么?回复:
再补充一下,buffer的话6.0-8.0如果与填料没冲突可以用PBS,大于7.5可以用20mMTris,4.0-6.0用醋酸。如果用的预装柱,Q柱的负载量还是很不错的,平衡好后高浓度上样(进样时flow我一般喜欢调低),梯度洗脱或步进洗脱时速度可以比较快。这里没有Q柱的图,给个自己做的DEAE SepharoseFF的图吧:
多谢赐教。用25mMTris,2mMDTT,pH8.5的A液前几天做成功过一次,纯化效果特好,可是接着再做就又不行了,要不不挂柱,要么就是挂上点每个洗脱浓度都有峰全是目标蛋白跟杂蛋白混杂,不知是什么原因,Buffer是同一台ph计调的,上样量,速度等所有条件都跟前次相同。回复:
我用的是Resource Q 1 ml柱,上样量16ml和上样速度3.5ml/min,洗脱速度1.5ml/min.AKTA purifier。请帮我想一下问题在哪吧,实在是找不出为什么来。另外我觉得可能PH8.5确实对蛋白有影响,我做成功的那次接着做分子筛离心后管底有大量的沉淀。回复:
离子交换的重复性一直是个问题,要每次获得好的结果很难
1.上样量16ml虽然可以,不过我倾向于浓缩后上浓一点的样,可适当调低上样速度,但是要注意小预装柱换流速(从高换到低)时基线会上抬,出现像锯齿一样的波形,从低打到高不会出现
2.pH值相差0.4pKa都会有很大影响,一定要准,否则一定重复不出来。pH计我们是定时交由中心室校对,pH标准品标明有效期,切勿混淆,污染。
3.同一预装柱使用次数的问题。第一次使用当然是没问题,但是使用三四次以后效果明显降低了。可能是我自己保养的问题,但是也涉及到柱子的清洗和的再生。1mL的预装柱是5个一盒卖的吧。如果蛋白量大,又要长期做的话,反复用一个小柱子是不适合的。我自己是用小kit盒摸了条件后优选出一个又订了空柱子和的。回复:
多谢赐教,如果我Buffer A里加了40mmol氯化钠的会影响挂柱吗?我这几次的尝试都是不挂柱,但能洗脱下来少量目标蛋白混的杂蛋白在胶上看比脱盐后多很多。回复:
既然你前面挂柱时每个洗脱峰都有目的蛋白,可能有盐存在会有一定的影响,可以把盐去掉,上样前测一下电导,流速调慢一点再试一下。另外你蛋白的状态不是很好,容易沉淀,杂蛋白与目的蛋白分不开,你看一下过分子筛时是不是在外水出峰,有可能目的蛋白和杂蛋白是一团东西。我碰到过这种情况,加了各种变性剂和去污剂都打不开。也碰到过一种蛋白挂阴、阳离子柱都不挂。回复:
多谢赐教,现在是杂蛋白挂柱,目标蛋白挂柱量较少,我就用的穿过浓缩后上分子筛,可他并不在外水体积处出峰,而是在柱子后三分之一处出峰。搞不清原因。回复:
既然不在外水出峰,应该蛋白状态还可以,估计重复不出来是什么细节没注意到,要不再试一下mono-Q看看,结合力挺强的。回复:
多谢赐教,现在能搞了,让杂蛋白挂柱,目标蛋白穿过。但是现在的问题是一经浓缩就沉。回复:
你好,我想请教您用过NI柱么?我在用NI柱的时候碰到不挂柱的问题,我也不知道什么原因,但是以上样后蛋白大部分都透过了,请赐教回复:
首先你表达的蛋白是带his tag 吗?即是克隆成功的吗?,然后就看你的的ph值,三ni柱有没有问题。我也是菜鸟,大家相互学习了。
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提供高盐环境、洗去高浓度盐离子的同时使DNA留在柱上、洗脱DNA,可以打电话给技术支持问一下哦.
请问,提供高盐环境,洗去高浓度盐离子的目的分别是什么?谢谢你!
高盐环境下DNA才会吸附在柱上。DNA溶液中含高浓度盐会影响进一步的酶切、连接等反应。
binding buffer 改变DNA pH等性质,以便结合柱子spw wash buffer洗掉杂质elution buffer洗脱DNA

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