费舍尔精确检验与卡方检验
&在统计学中，经常使用费舍尔检验和卡方检验用于衡量统计结果的显著性。如两组实验产生的结果是否具有显著差异。此时常用的检验有卡方检验和费舍尔精确检验。
表1：四格表材料
(a+c)/(a+b+c+d)
一.皮尔逊卡方检验
卡方检验有两种不同的检验：1.成组检验(不配对检验)；2.配对检验(对一对象两种处理结果的比较)。
1.成组检验：用于比较两组结果是否具有显著的差异：针对表1的含义为：第一组实验中的有效率与第二组实验中的有效率有无显著差异。通过计算卡方值，进而求得p-value。零假设是：两组实验结果无显著差异，结果是由误差引起的。备择假设：两组结果显著差异。p值越小，表示越拒绝零假设。
& 在计算卡方值的过程中，需要理论频数Trc =
Nr*Nc/n。Trc表示第r行第c列的理论数；Nr表示第r行的合计数；Nc表示第c列的合计数；n为总例数。根据卡方公式，即可求得卡方值。当卡方检验不适用时，可以采用费舍尔精确检验。
备注：卡方检验分为：
4格表的假设检验(适用于两组的百分比差别的显著性检验，如正常和抗药性两组蛋白质中各自含有的无序蛋白质百分比有无显著差异，当抗药性中的百分比高，且两者显著差异性。认为抗药性蛋白质富含无序蛋白质）。
行*列表的假设检验(适用于两组以上的百分比差别的显著性检验)。
2.配对检验：用于检验两中不同的方法是否具有显著差异：在计量资料方面，同一对象实验前后差别或配对资料的比较与两样本均数比较方法有所不同。配对检验主要是同一组对象在两种不同处理方式下的结果，用于检验两种处理方式是否具有显著差异，并根据各自的百分比说明哪个好。
此时卡方计算公式为：
二.Fisher Exact Test：
&exact表示计算的结果是准确的，不是近似的结果。
&计算的p-value越小，表示越远离零假设null
hypothesis。一般以0.05或0.01为cutoff。
&用于检验：两个行的不同取值，如{新药、旧药}，对两个列{改善、无效}的取值是否有区别。零假设为：两种药对疗效无差别。
理论依据是：超几何分布，非卡方检验的范畴。超几何分布的一个形象例子是：有N件物品，M件为次品，求取n件，其中有k件为次品的概率。=(M,k)*(N-M,n-k)/(N,n)
基本思想是：在2*2列联表中，四格表周边和（即边际分布）计数固定不变的条件下，计算表内4个实际频数变动时的各种组合之概率Pi；再按照检验假设用单侧或双侧的累计概率P，依据所取的检验水准做出推断。
a. 实际频数变动的组合数是：周边和计数中最小的数加1.
b. 每个组合的概率服从超几何分布，等于(a+b)*(c+d)*(a+c)*(b+d)/a!b!c!d!n!
c. 双侧检验：在所有四格表中，将概率小于或等于原四格表的概率相加，得到双侧概率
单侧检验：先分别计算原四格表(包括)以左的概率之和，以及原四格表(包括)以右的概率之和。一般情况下，取两者中的小值，即为单侧检验概率。
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Nanjing University of Aeronautics and Astronautics
The Graduate School
College of Aerospace Engineering
Impact Test and Finite Element Analysis of
Foamed Light-weight Cement based
on the Airport Pavement
A Thesis in
Geotechnical Engineering
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Professor Zhang Xiaoping
Submitted in Partial Fulfillment
of the Requirements
for the Degree of Master of Engineering
December, 2011
本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师指导下，独立进
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南京航空航天大学硕士学位论文
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【求助】卡方检验与fisher确切概率
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这个帖子发布于6年零272天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
最近看文献，发现很多文章在进行显著性比较时，文章中提到的是卡方检验，结果里面给出χ2 和P值但是代入spss里面算，最小理论值有＜5的，那应该按fisher确切概率呀？为什么看到的文章几乎没有提到用fisher的？全是清一色卡方？
不知道邀请谁？试试他们
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楼主翻翻书看看，条件好像弄错了，我罗列了一下：1.n大于等于40.所有理论频数大于等于5---用卡方检验2.n大于等于40，所有理论频数大于1，小于5----用校正的卡方3.n小于40，理论频数小于1-----用fish精确概率法
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一个原因是你看到的文章太少，不可能没有没用fisher确切概率法的文章。二是除非出现单外内为0的频数，fisher确切概率法一般和卡方的结果差不多，既使在最小理论值＜5的情况下。你可以自己做个模拟数据看看就明白了。
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同意Hexm。有些编辑和作者对统计学不了解，只知道用卡方，不知道确切概率法，也是其中一个原因
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有些会用软件，对什么时候该用什么不甚很清楚
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楼主翻翻书看看，条件好像弄错了，我罗列了一下：1.n大于等于40.所有理论频数大于等于5---用卡方检验2.n大于等于40，所有理论频数大于1，小于5----用校正的卡方3.n小于40，理论频数小于1-----用fish精确概率法
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恩，谢谢，我搞明白了我查的统计书上这个部分是说校正公式或者fisher都可以哎2.n大于等于40，所有理论频数大于1，小于5----用校正的卡方
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N&40,而理论频数又小于1呢？
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搞懂了，n小于40，理论频数小于1-----用fish精确概率法 ，有一个“或”字
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我也想请教一下 我做的卡方检验
1&理论频数&5
应该用校正的卡方 怎么SPSS软件里结果只出来了泊松卡方
和费舍尔卡方
没有校正卡方值那一项
是不是直接用费舍尔卡方就行了
，请各位解答。谢谢
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理论上讲，Fisher's exact probability 任何四格表资料都能用！
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2乘4的列联表资料也是这样吗
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2乘4的列联表资料要看资料的性质（有序、无序等）以及研究目的确定统计方法！
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刀锋入骨 楼主翻翻书看看，条件好像弄错了，我罗列了一下：1.n大于等于40.所有理论频数大于等于5---用卡方检验2.n大于等于40，所有理论频数大于1，小于5----用校正的卡方3.n小于40，理论频数小于1-----用fish精确概率法MARK
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biostat 2乘4的列联表资料要看资料的性质（有序、无序等）以及研究目的确定统计方法！ 请问如果是2乘4的列表资料分组是有序资料的话，该用哪种方法呢？可以用Fisher吗？
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效应指标是有序的，应该用秩和检验或者Ridit分析
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如果仅是分组有序，根据研究目的确定：1，如果组间比较可做Pearson卡方检验，理论数过小（如小于5超过1/5格子）可用Fiisher精确概率或者相邻两组合并重新分析；2，也可做趋势检验等。
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一般的可以按照教科书上适用的条件来选择用哪种方法。fisher精确概率法是最准确的，在样本量大的时候与卡方检验结果非常接近，因卡方检验计算简便、速度快，所以这时选择用卡方检验方法计算。
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harry1843 一般的可以按照教科书上适用的条件来选择用哪种方法。fisher精确概率法是最准确的，在样本量大的时候与卡方检验结果非常接近，因卡方检验计算简便、速度快，所以这时选择用卡方检验方法计算。 其实软件都会全部给出来的，只要电脑不是很坑爹的话。
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同意楼上，解释的非常准确
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楼主是书看错啦
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那如果是n&40,T也&5，也可以用Fisher确切检验吗？刚看到一篇文献就是这样的。请问这样可以吗？
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123香寒笑 那如果是n&40,T也&5，也可以用Fisher确切检验吗？刚看到一篇文献就是这样的。请问这样可以吗？可以，没有任何问题。再啰嗦一句，凡是卡方可以用的，Fisher精确检验就可以；而反之则未必。以前数据大的时候选卡方而不用Fisher精确检验是因为计算机运算太慢，而且卡方公式简单得多，可以手算。现在的电脑速度太快，这都不算个事了。
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原来是这样啊，谢谢回答。
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11:50:31 上传
我在做交叉列表分析的时候，下面卡方检验的期望频次小于5的格值数超过了25%，那我能不能用费舍尔精确数据的检验结果，如上图，是否就是0.109？
那我可否在即使期望频次小于5的格值数小于了25%的情况之下也使用舍尔精确数据的检验结果（是否是小于0.05说明差异显著）？
载入中......
啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊
Chi-Square Tests
& & & && && && && && && & Value& & & & df& && && & Asymp. Sig.& &Exact Sig.& &Exact Sig.& &Point
& && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && &(2-sided)& && &(2-sided)& &&&(1-sided)& & Probability
Pearson Chi-Square& & & & 7.322(a)& & & & 4& & & & .120& & & & .120& & & & & & & & & & & &
Likelihood Ratio& & & & 7.481& & & & 4& & & & .113& & & & .133& & & & & & & & & & & &
Fisher's Exact Test& & & & 7.419& & & & & & & & & & & & .109& & & & & & & & & & & &
Linear-by-Linear
Association& & & & .687(b)& & & & 1& & & & .407& & & & .442& & & & .229& & & & .048
N of Valid Cases& & & & 160& & & & & & & & & & & & & & & & & & & & & & & &
a& & & & 4 cells (40.0%) have expected count less than 5. The minimum expected count is 2.81.
b& & & & The standardized statistic is -.829.
当期望频次小于5的格子数超过了20%，那就应用Fisher检验，就是你说的结果。Fisher确切检验的理论依据是超几何分布，而卡方检验的理论基础是卡方分布，所以如果期望频次小于5的格子数小于20%，检验选择卡方检验。
尽最大努力，做最坏打算！
谢谢&&cjblovebj&&您的回答~
使用费舍尔精确检验的结果！
麻烦再请问下您，
& && && && && && && && && && && && & 重视物质需要3& && && && && && && && && && &
& && && && && && && & 完全不同意& & 不同意& &不一定& &同意& &非常同意& && &&&Total& && &&&
性别& && &&&男& && &&&5& && && && && && & 23& && && &28& && && & 26& && && &3& && && && && && &85
& && && && && &女& && &&&3& && && && && && &&&21& && && &37& && && &11& && && &3& && && && && && &75
Total& && && && && && & 8& && && && && && &&&44& && && &65& && && &37& && && &6& && && && && &&&160
可否用卡方检验？费舍尔精确检验的结果小于0.05就说明有显著差异是吧？谢谢您
[localimg=562,247]1[/localimg]
对SPSS不是很了解&&不知道有没有您说的期望频数。
14:00:21 上传
对SPSS不是很了解&&谢谢您~我做的是交叉列表分析 就输出了这两个表.....
加油，你就会解决的
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