为什么Simple western blot条带中空的条带分子量和传统western blot条带中空的有差异

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【求助】western blot 结果中的蛋白条带分子量怎样具体确定?
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western blot 结果中的蛋白条带出现在marker的两个条带之间(36KD和55KD),那条带的分子量怎样具体确定?一抗说明书上有预测的分子量和研究所得的分子量范围,无法具体确定。谢谢!
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通过氨基酸序列可以计算理论分子量,实际的分子量要用质色联用来确定,比较精确。SDS-PAGE测定分子量比较粗略,用长槽电泳,以marker各分子的迁移率做标准曲线,比对你的目标蛋白。
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理论上的分子量已经计算过了,和实际蛋白条带所在位置还是有所差异的。谢谢!
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关于丁香园为什么western blot band条带的大小和预测的分子量大小不同?
这小伙n1ce274
但即使是这样,Western Blot得到的条带大小依然会和预计的分子量大小有出入.大部分常见的原因如下:1.翻译后修饰—比如蛋白的磷酸化,糖基化等,这些都会增加蛋白的分子量大小.2.翻译后剪切—比如很多蛋白首先被合成为前体形式,然后通过剪切获得生物学活性,比如pro-caspases.3.剪接变异体—相同的基因,经过选择性剪接会产生不同分子量大小的蛋白.4.相对电荷—氨基酸的组成 (带点 vs 不带电) 5.多聚体—比如蛋白二聚体.
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【求助】请教Westernblot条带中间细(甚至空),而两头粗的原因可能有哪些?谢谢
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这个帖子发布于5年零53天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
请教Westernblot条带中间细(甚至空),而两头粗的原因可能有哪些?谢谢 大致条件:电泳:200v电转:半干,15v,30min1st Ab: overnight2nd Ab: 1h,RTDevelopment: ECL, 3min
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可能是你加的样有杂质
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hhh625128 可能是你加的样有杂质能说具体点吗?不是很明白。
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就是比如细胞裂解液裂解后,加了buffer煮,煮完没离心活离心不干净。样加到孔里杂质一般掉中间,电泳时候中间就没了啊,我猜
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hhh625128 就是比如细胞裂解液裂解后,加了buffer煮,煮完没离心活离心不干净。样加到孔里杂质一般掉中间,电泳时候中间就没了啊,我猜谢谢回复。但是我觉得这个原因有点牵强。
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上样量是不是比较多?降低上样量看看呢。
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luch75 上样量是不是比较多?降低上样量看看呢。10ug(about10ul) sample, 应该不多啊
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蛋白不均一,上样前用涡旋仪混下试试看。
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xiongfeitcm 蛋白不均一,上样前用涡旋仪混下试试看。有vortex before loading sample啊, 这个应该也不是问题的。
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你的maker也是这样哑铃状的吧?那就是胶配的有问题,不是配方有问题,而是你制版没夹好,凝的时候没凝好
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hhh625128 你的maker也是这样哑铃状的吧?那就是胶配的有问题,不是配方有问题,而是你制版没夹好,凝的时候没凝好Thanks so much.Development的时候marker没有显示。但是在transfer以后,marker还是很正常的。不过你说的这个可能性还是有的,只是做的时候又不漏胶,如何预先知道配胶有问题啊?我一般把gel的recipe全部加完后,再vortex几下,应该也是均匀了的,隔个半分钟让bubble减少一点,然后用1ml的tips加resolving gel,一般加个7.5ml, 再用95% ethanol封胶,这个过程有哪里不妥的地方吗?
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kanry 有vortex before loading sample啊, 这个应该也不是问题的。那就是制胶的问题了,我用的BIO-RAD制胶器玻璃板用得久了就是有点漏,但是感觉最影响胶的就是放置的时间问题,尽量凝的好一点,配胶时候的细节多注意。
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还有上样前加热煮沸的样品要放置冷下来后再上,否则会导致胶变形也会出现这种结果。
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xiongfeitcm 还有上样前加热煮沸的样品要放置冷下来后再上,否则会导致胶变形也会出现这种结果。这个倒是没有做到,下次改进一下看看情况如何。Thanks so much.
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你找到真正原因了吗?我现在也遇到了同样的问题!
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我也想知道
到底是交的问题还是loading的问题
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后面想想,单从结果看,就是样品在band的两端多,中间少,但这也可能是假象。因为也可能是蛋白在中间的地方聚集较多,做ECL时,导致中间部分荧光淬灭,而形成这样的哑铃型。因此,可以试试减少样品上样量,或者减少一抗的incubation时间,或者用ECL plus试一下。个人观点,仅供参考。
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有可能是浓缩胶梳孔内有气泡,影响样本在后续电泳中浓缩和分离。建议分离胶和浓缩胶须完全聚合,插梳子时可稍倾斜缓慢插入,避免混入气泡。拔梳子时可边加水缓冲液边拔,以免有气泡进入梳孔使梳孔变形。拨出梳子后用缓冲液冲洗胶孔两遍以去除残胶。点样后须立刻电泳,避免样品扩散。
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楼主现在的问题解决了吗?
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请教Westernblot条带中间细(甚至空),而两头粗的原因可能有哪些?谢谢
电泳:200v
电转:半干,15v,30min
1st Ab: overnight
2nd Ab: 1h,RT
Development: ECL, 3min 做成竖状的
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我也出现很多类似的问题,求答案~~~
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我最近也是出现这样的情况,不知道怎么解决。难道不是转膜的问题吗?
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