vmd如何导入键角大小比较信息

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-06-01 01:19 标签： 键角大小比较
这个模型导入不了vmd文件？【mikumikudance吧】_百度贴吧
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这个模型导入不了vmd文件？收藏
什么动作文件都导入失败，只能自己摆！问一下是怎么回事，（这个是在吧里下载的）ia beta2
你截一下帧控制的界面看看……
呃算了QQ上说
pmx模型要把系统语言转到日文
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&【求助】请问VMD中氢键如何统计
【求助】请问VMD中氢键如何统计
作者 Luv_XiaoMian
VMD虽然自带了氢键的分析，但是具体不知道如何操作
一些参数设置尤其是selection部分
另外我是导入的LAMMPS的DUMP文件，不是由VMD建模，不知道这个有没有影响
请教各位，谢谢。
补充，上传了dump文件，导入VMD后的图片如下
这是冰的结构，selection1部分填的name 2 1,按理说应该有的，但是氢键分析里找不到……
[ Last edited by Luv_XiaoMian on
at 11:20 ]
额整个体系是都是水分子，LAMMPS的时候分别定义了TYPE 1 TYPE2，这个有影响吗？
但是选取的时候不论输1 2 还是 H O， 计算结果都一个都没有
求指点，谢谢了！
在水分子中，是根据氢键的键能作为标准进行统计的，可以参考《the art of molecular dynamics》第八章第四节。嘿嘿。至于软件我不知道。
楼主要的是比方说这样?
hbond.png，
话说为什么图片上传了却不能显示阿?
引用回帖:: Originally posted by gn at
楼主要的是比方说这样?setup.pnghbond.png
hbond.png... 对，就是这个。
但是我的导入的lummps的DUMP文件，仅有H,O两种原子，
SELECTION 1应该怎么填呢？
引用回帖:: Originally posted by gn at
话说为什么图片上传了却不能显示阿? 显示了。
请问写的name OH2 H是什么意思啊，是根据导入的模型的来定义的吗，还是水中的氢键就是这样写？
我意思是我导入的lammps数据，H原子定义为type1，O原子type2，以12指代，没有H O，应该怎么写呢？
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。然后就OK了
制作VMD铃声的必备工具　
　　1，声音编辑工具，集成了声音的格式转换，编辑，裁剪等功能的软件，常用的有COOLEDIT、GOLDWAV 5。1汉化版。（我用的...
可以使用PalmReader打开。
如果想把PDB文件转换成TXT文件查看，可以使用WavePDB转PDB文件阅读器。
VMD是一个外来语，是英文 Visual Merchandising的缩写
vmd的制作软件就可以播放啊
VMDMaker V1.1 汉化版,下载地址：
打开该文件选“另存为...”，再选保存类型为“.txt”就行了，不过，除了文字和标点符号，其他的都会丢失。
答: 你好，瑞银信APP有付款结账、转账汇款、信用卡还款、余额查询等功能，还是比较齐全的。瑞银信官网上有下载链接。
答: 资源间的数据交换和授权认证、安全控制都在这一层控制实现
答: 分享个：P2P终结者软件~就挺厉害的~
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这个不是我熟悉的地区【MMD】动作以及相机数据VMD文件，详细点进来说_百度知道
【MMD】动作以及相机数据VMD文件，详细点进来说
br />然后，用了一下打开方式，我当时是选择MMD制作软件打开的，【注：我曾经打开过，在没有改变打开方式前】然后里面什么也没有，我用模型控制和附件控制打开都没有用，我也试过在有模型的情况下打开，可是也打开不了，我该怎么办将它弄回原样
我有更好的答案
打开mmd软件以后，从文件栏里载入动作数据也不行吗？
采纳率：73%
右键打开方式选择MMD
= =我就是用MMD打开的(╯°口°)╯(┴—┴
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VMD软件显示多个nc-2e轨道的问题
在线时间29 小时
帖子威望eV
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老师您好，我想把具有相同占有数的nc-2e的结果放到同一个图中显示， 就像下图中显示的这样。我看到了您有个帖子讲的是怎么在VMD中同时显示多个文件的等值面，但是我没有找到您说的那个RDG绘图脚本（您帖子里的原话是这样说的：已提供的那个RDG绘图脚本里的每一行命令都对应于图形界面的一个操作，只要自己弄会了怎么通过手动在图形界面操作来显示填色等值面图，就自然而然明白怎么再显示更多的填色等值面。）
(20.09 KB, 下载次数: 0)
17:31 上传
在线时间2541 小时
帖子威望eV
对于当前的目的，就用此文3.2节提供的脚本就行了
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
RDG和这个一丝关系也没有。
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对于当前的目的，就用此文3.2节提供的脚本就行了
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
谢谢Sob老师的指点。&&关于将.cube文件导入到VMD软件中，有的文件导入后，经过设置，会出现既有原子又有化学键的结构图，但是有的文件导入后只出现原子而没有化学键，请问老师这是什么原因造成的呢？
在线时间2541 小时
帖子威望eV
谢谢Sob老师的指点。&&关于将.cube文件导入到VMD软件中，有的文件导入后，经过设置，会出现既有原子又有 ...
没出现键是因为原子间距离太远，没被判断成键
一种方法是用mouse-add/remove bond功能，点击相应两个原子让它们成键，另一种做法是drawing method改成dynamic bond，把判断成键的阈值调大
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没出现键是因为原子间距离太远，没被判断成键
一种方法是用mouse-add/remove bond功能，点击相应两个原 ...
谢谢Sob老师
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没出现键是因为原子间距离太远，没被判断成键
一种方法是用mouse-add/remove bond功能，点击相应两个原 ...
sob老师&&请问在VMD中作多中心分析图有手册吗&&
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sob老师&&请问在VMD中作多中心分析图有手册吗
VMD根本就没法做什么多中心分析，这只是可视化程序而已
多中心键讨论方法看
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VMD根本就没法做什么多中心分析，这只是可视化程序而已
多中心键讨论方法看
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好的 谢谢sob老师

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