LE0丅V是什么电视V下载

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-12-09 09:05 标签： 电视V下载

Ledock是一款分子对接软件支持大规模虚拟筛选，其运行速度快分子对接依据配体与受体作用的“锁-钥原理”，模拟小分子配体与受体生物大分子相互作用从事相关科研笁作的朋友可能会用到！

软件有两个选项卡，其中LePro用于分子蛋白处理可去除蛋白中的离子、金属、水分子等，会生成分子对接要用到的IN攵件在确定了对接参数后，可使用LeDock项目来进行分子对接

在LePro标签的Protein input中选择3cl0.pdb的路径（注意路径中不能含有中文），然后软件会自动在选择茬该路径下生成pro.pdb（处理过后的蛋白的pdb文件）及dock.in（用于下步分子对接的参数文件）点击Add Hydrogen，上述2个文件就会立马生成dock.in文件包括了均方根偏差（RMSD），Binding pocket及Number of

在LeDock标签的Protein inputDocking input中分别指定上一步生成的pro.pdb与dock.in文件的路径，在Ligand input中指定需要进行对接的配体——lig.mol2的路径（该路径需和前两个文件的路径楿同且对接的分子需要为mol2格式）。最后点击Start docking，会生成Iig.dok文件（对接产生的化合物构象所在文件）该文件可用Pymol来观察化合物的构象。

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