[R]Ubuntu-16.04&R&安装及Jupyter&notebook&配置_Canal_my_新浪博客
[R]Ubuntu-16.04&R&安装及Jupyter&notebook&配置
问题：&Ubuntu-16.04 及 16.10 配置R语言环境，
以及在Jupyter中添加R kernel.
解决方法：
通常在Terminal下直接apt-get
即可，在16.10下可以get到R-3.3.1，目前最新好像是 R-3.4.2，可以去官方网站下载源码编译
~ sudo apt-get install
r-base​​
2. 在jupyter
notebook中配置R的kernel
近期在Jupyter下跑python，方便边调试边记笔记。因为Jupyter也支持R语言，所以尝试添加R
kernel到Jupyter中。 主要依赖 "IRkernel"
包。(有些包可能需要翻墙才能下载，具体的方法请DIY。)&配置方法如下：
(1) 安装必要的lib
~ sudo apt-get install libzmq3-dev libssl-dev
libcurl​4-openssl-dev
~ sudo R # 进入R环境​
​&install.packages(c('repr',
'IRdisplay',
'evaluate',
'devtools',
'digest'))&
注： 会提示选择mirrors， 建议选择
&devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
&​&IRkernel::installspec()
如果显示​如下结果，说明配置成功。&
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in
/home/xxx/.local/share/jupyter/kernels/ir​
References
[2] ​
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如何建立一个Jupyter笔记本在Ubuntu 16.04运行IPython的
IPython是Python的交互式命令行界面。
Jupyter Notebook为许多语言提供了一个交互式Web界面，包括IPython。
本文将引导您完成设置服务器以运行Jupyter Notebook，以及教您如何连接和使用笔记本。
Jupyter笔记本（或简称笔记本）是由Jupyter Notebook应用程序生成的文档，它包含计算机代码（例如Python）和丰富的文本元素（段落，方程，数字，链接等），有助于展示可重复的研究。
在本指南结束时，您将能够使用运行在远程服务器上的Ipython和Jupyter Notebook运行Python 2.7代码。 为了本教程的目的，使用Python 2（2.7.x），因为许多数据科学，科学计算和高性能计算库支持2.7而不是3.0+。
要遵循本教程，您需要以下内容：
Ubuntu 16.04 Droplet
使用sudo特权的非root用户（ 介绍了如何设置起来。） 本教程中的所有命令都应以非root用户身份运行。 如果需要该命令的root访问权限，它会在前面加sudo 。 介绍了如何添加用户，并给他们sudo访问。
- 安装Python 2.7和Pip
在本节中，我们将安装Python 2.7和Pip。
首先，更新系统的包索引。 这将确保旧的或过时的包不会干扰安装。 sudo apt-get update
接下来，安装Python 2.7，Python Pip和Python Development： sudo apt-get -y install python2.7 python-pip python-dev
安装python2.7将更新到最新版本的Python 2.7，而python-pip将安装Pip这使我们能够管理Python包，我们想用。 有些Jupyter的依赖，可能需要编译，在这种情况下，你需要编译Python的C-扩展的能力，所以我们安装python-dev为好。
要验证您是否已安装python： python --version
这将输出： OutputPython 2.7.11+
根据最新版本的Python 2.7，输出可能不同。
您还可以使用以下命令检查是否安装了pip： pip --version
您应该类似于以下内容： Outputpip 8.1.1 from /usr/lib/python2.7/dist-packages (python 2.7)
类似地，根据你的pip版本，输出可能略有不同。
- 安装Ipython和Jupyter Notebook
在本节中，我们将安装Ipython和Jupyter Notebook。
首先，安装Ipython： sudo apt-get -y install ipython ipython-notebook
现在我们可以继续安装Jupyter Notebook： sudo -H pip install jupyter
根据在Ubuntu apt-get存储库中的pip的版本，您可能会在尝试安装Jupyter时收到以下错误： OutputYou are using pip version 8.1.1, however version 8.1.2 is available.
You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command.
如果是这样，你可以使用pip将pip升级到最新版本： sudo -H pip install --upgrade pip
升级pip，然后尝试再次安装Jupyter： sudo -H pip install jupyter
- 运行Jupyter Notebook
您现在拥有运行Jupyter Notebook所需的一切！ 要运行它，请执行以下命令： jupyter notebook
如果你在安装了JavaScript的系统上运行Jupyter，它仍然会运行，但它可能会给你一个错误，指出Jupyter Notebook需要JavaScript： OutputJupyter Notebook requires JavaScript.
Please enable it to proceed.
要忽略错误，你可以按Q ，然后按Y确认。
Jupyter Notebook的活动日志将打印到终端。 当您运行Jupyter Notebook时，它会在特定的端口号上运行。 您正在运行通常会在端口运行的第一台笔记本8888 。 要检查Jupyter Notebook正在运行的特定端口号，请参阅用于启动它的命令的输出： Output[I NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /home/sammy
[I NotebookApp] 0 active kernels
[I NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at: http://localhost:8888/
[I NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
如果你正在运行一个本地的Linux计算机（不在一个Droplet）上Jupyter笔记本电脑，你可以简单地浏览到localhost :8888连接到笔记本Jupyter。 如果您在Droplet上运行Jupyter Notebook，则需要使用SSH隧道连接到服务器，如下一节所述。
此时，您可以保持SSH连接打开并保持Jupyter Notebook运行，或者可以退出应用程序，并在设置SSH隧道后重新运行它。 让我们保持简单，停止Jupyter Notebook过程。 一旦我们有SSH隧道工作，我们将再次运行它。 要停止Jupyter笔记本电脑过程中，按CTRL+C ，类型Y ，并创下ENTER确认。 将显示以下内容： Output[C 12:32:23.792 NotebookApp] Shutdown confirmed
[I 12:32:23.794 NotebookApp] Shutting down kernels
- 使用SSH隧道连接到服务器
在本节中，我们将学习如何使用SSH隧道连接到Jupyter Notebook Web界面。 由于Jupyter笔记本电脑上的Droplet的特定端口上运行（如:8888 ， :8889等），SSH隧道可以连接到Droplet的港口安全。
接下来的两个小节描述如何创建SSH隧道从1）Mac或Linux和2）Windows。 请参阅本地计算机的子部分。
SSH使用Mac或Linux进行隧道传输
如果您使用的是Mac或Linux，用于创建一个SSH隧道的步骤类似于指南除了有在添加其他参数ssh命令。 本小节将概述中所需的其他参数ssh命令隧道成功。
SSH隧道可以通过运行以下SSH命令来完成： ssh -L 8000:localhost:8888 your_server_username@your_server_ip
该ssh命令打开一个SSH连接，但-L指定本地（客户端）主机上的指定端口将被转发到远程侧（Droplet）给定主机和端口。 这意味着，无论在第二端口号上运行（即8888 ）上的Droplet会出现在第一端口号（即8000在本地计算机上）。 你应该改变8888到Jupyter笔记本电脑上运行的端口。
（可选）更改端口8000到您选择的一个（例如，如果8000是由另一个进程使用）。 使用端口大于或等于8000 （即8001 ， 8002等），以避免使用的端口已经被另一个进程使用。 server_username是你在其中创建和Droplet的用户名（如森美） your_server_ip是的IP地址你的Droplet。 例如，对于用户名sammy和服务器地址111.111.111.111 ，则命令为： ssh -L 8000:localhost:8888 sammy@111.111.111.111
如果运行后没有错误显示出来ssh -L命令，你可以运行Jupyter笔记本： jupyter notebook
现在，从本地计算机上的Web浏览器，打开Jupyter笔记本Web界面与http://localhost: 8000 （或任何端口您选择号码）。
SSH隧道与Windows和Putty
如果您使用的是Windows，你也可以很容易地创建一个使用PuTTY简列如一个SSH隧道 。
首先，输入服务器URL或IP地址作为主机名，如图所示：
接下来，单击SSH左侧窗格底部展开菜单，然后单击隧道 。 输入用于在本地计算机上访问Jupyter的本地端口号。 选择8000或更大（即8001 ， 8002等），以避免由其它服务使用的端口，并且设置目的地为localhost: 8888 ，其中:8888是Jupyter手提电脑上运行的端口的数量。 现在，单击Add按钮，端口应该出现在转发端口列表：
最后，单击打开按钮通过SSH隧道所需的端口连接到服务器。 导航到http://localhost: 8000在Web浏览器（或任何你选择的端口）连接到服务器上运行Jupyter笔记本。
- 使用Jupyter Notebook
本节讨论使用Jupyter Notebook的基础知识。 到这一点，你应该有Jupyter Notebook运行，你应该使用网络浏览器连接到它。
Jupyter笔记本是非常强大，有很多功能。 本节将概述几个基本功能，让您开始使用笔记本。 自动，Jupyter Notebook将显示从其运行的目录中的所有文件和文件夹。
要创建一个新的笔记本文件，请从右上角的下拉菜单中选择New& 的Python 2：
这将打开一个笔记本。 我们现在可以在单元格中运行Python代码或将单元格更改为markdown。 例如，更改第一个单元格通过点击顶部导航栏中细胞 & 细胞类型 & 减价接受降价。 现在，我们可以编写使用降价笔记，甚至把他们之间包括写在LaTeX的公式$$符号。 例如，在将其更改为markdown后，在单元格中键入以下内容： # Simple Equation
Let us now implement the following equation:
$$ y = x^2$$
where $x = 2$
要打开降价到丰富的文本，按CTRL+ENTER ，下面应该是结果：
您可以使用markdown单元格来记录和记录您的代码。 让我们实现那个简单的方程并打印结果。 选择插入 & 插入单元格下方插入和单元格，输入以下代码： x = 2
要运行代码，按CTRL+ENTER 。 以下应该是结果：
您现在可以像使用任何其他Python开发环境一样，包括库和使用笔记本。
恭喜！ 你现在应该能够使用运行在Droplet上的Jupyter笔记本使用markdown编写可重现的Python代码和注释。 为了得到从顶部导航菜单Jupyter笔记本，选择帮助 & 用户界面游的快速浏览。
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(C)2018 Howtoing运维教程 京ICP备号-1安装使用jupyter（原来的notebook）
时间： 11:44:08
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标签：&&&&&&&&&&&&1。安装pyzmq使用pip install pyzmq,安装不成功。使用easy_install.exe pyzmq，安装成功。2.安装tornadopip tornado安装完尚不成功，继续找3.安装jinja2pip install jinja24.运行依旧不成功，提示错误：IPython&notebook&format&depends&on&the&jsonschema&package:&&&&Please&install&it&first.继续安装：pip install jsonschema按照提示安装完成。运行：ipython notebook出现jupyter,在其右侧，选择“new”，选择“Python2”开始jupyter如今更名为：jupyter，即为原来的notebook参考资料：1.2.http://blog.163.com/jinjunwei2003jinjunwei2003jinjunwei/blog/static//3.http://news.sciencenet.cn/htmlnews/201.shtm标签：&&&&&&&&&&&&原文：http://blog.csdn.net/superdont/article/details/
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