如何做护理质控利用生物信息学进行质控？

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2022-11-27 18:03 标签： 最新疫情基因测序

## 保证所有的软件都是安装在 wes 这个环境下面

deeptools提供bamCoverage和bamCompare进行格式转换，为了能够比较不同的样本，需要对先将基因组分成等宽分箱(bin)，统计每个分箱的read数，最后得到描述性统计值。对于两个样本，描述性统计值可以是两个样本的比率，或是比率的log2值，或者是差值。如果是单个样本，可以用SES方法进行标准化。

peaks相关基因集的注释

  • 当然了，本教程讲解的是单端测序数据的处理，如果是双端测序，里面的很多参数是需要修改的。
  • 不过，只要你完整的看完了我前面的流程，掌握了linux和R，以及必备的基础生物信息学知识，我相信你肯定能hold住双端测序数据的学习啦。
  • 本来以为我把ChIP-seq教程写完了：

我要回帖

更多关于 最新疫情基因测序 的文章

 

随机推荐